فى إطار بدء نشاط جامعة النيل المتخصصة فى الدراسات العليا و البحوث فى مجالات الاتصالات و تكنولوجيا المعلومات, تطلق الجامعة بدءا من العام الدراسى الحالى باقة من البرامج الأكاديمية لنيل درجة الماجستير و ذلك فى المجالات الآتية: إدارة التكنولوجيا, إدارة الأعمال, الاتصالات و تكنولوجيا المعلومات.

تقدم الجامعة برامج الماجستير بالتعاون مع كبرى الجامعات العالمية حيث أن برنامج إدارة التكنولوجيا Management of Technology (MoT) -  الذى يعد الأول من نوعه فى مصر و الشرق الأوسط - يتم بالتعاون مع جامعة مينسوتا  University of Minnesota و هى من كبرى جامعات الولايات المتحدة الأمريكية, و برنامج إدارة الأعمال يقدم بالاشتراك مع الجامعة الاسبانية University of Navarra , و برنامج الاتصالات و تكنولوجيا المعلومات  (هندسة البرمجيات) يتم بالتعاون مع مركز تقييم و اعتماد هندسة البرمجيات التابع لهيئة تنمية صناعة تكنولوجيا المعلومات.

جدير بالذكر أن جامعة النيل أنشأت بقرار جمهورى فى عام 2006 و من المقرر إنشاؤها فى منطقة الشيخ زايد بمدينة 6 أكتوبر و هى جامعة لا تهدف للربح حيث يتم صافى الفائض من النشاط بالكامل نحو دعم نشاط الجامعة و يأتي إنشاء هذه الجامعة التكنولوجية ضمن خطة الدولة للتنمية التكنولوجية و خاصة فى مجال الاتصالات و تكنولوجيا المعلومات بإشراف من وزارة الاتصالات و تكنولوجيا المعلومات.

و تهدف الجامعة الى إنشاء قاعدة علمية و تكنولوجية متميزة تعنى أساسا بالبحث التطبيقي فى جميع المجالات العلمية المتقدمة من خلال شراكة وثيقة مع الصناعة و مؤسسات الأعمال المصرية فى مجال الاتصالات و تكنولوجيا المعلومات و بالتعاون مع كبرى الجامعات و مراكز الأبحاث العلمية. و يشكل مجلس الجامعة من خلال المؤسسة المصرية لتطوير التعليم التكنولوجي و هى مؤسسة لا تهدف للربح تشارك فيها وزارة الاتصالات و تكنولوجيا المعلومات و نموذج جديد للشراكة يتم تطبيقه بين الحكومة و القطاع الخاص.